五年一贯制又称“初中起点大专教育”，招收参加中考的初中毕业生，达到录取成绩后，经过三年中等职业教育学习,通过转段考试合格后,升入高职阶段学习，学业期满颁发国家教育部统一印制的《普通高等学校毕业证书》,此学历为国家承认的全日制专科学历，毕业生具有继续接受本科以上教育的资格。

为响应国家大力发展职业教育的号召，为了让初中毕业生有机会升入全日制普通高等职业院校学习，取得国家认可的专科文凭，给未来就业打下坚实的基础，经相关部门批准，重庆公共运输职业学院从2020年起，正式开始“五年一贯制”中高职贯通培养招生。学院现开设电力机车运用与检修、城市轨道交通供电、城市轨道交通信号、铁道运输管理、会计电算化、汽车运用与维修、计算机平面设计、铁道与桥梁工程施工、建筑工程施工等10个专业。